1985年11月2日，九三学社中国科学技术大学支社委员会成立，在校党委和九三上级组织的领导和关怀下，2004年1月3日发展为九三学社中国科学技术大学基层委员会，截止2021年9月1日，已有81名社员，正高35人，副高38，中级8人，高级职称约占90%，博士38人，占46.9%，女社员22人，占27.2%，退休社员30人，占37%。
从中国科学技术大学成立早期以严济慈为代表的九三先贤，到如今的“九三楷模”潘建伟，中国科大九三学社社员始终关心国家大事，与学校风雨同舟，竭尽全力服务于国家和学校的发展与建设；不断加强自身建设，努力履行职责，结合自身特点，积极开展建言献策、参政议政、社会服务等活动。